Pagrindinis skirtumas tarp POP3 ir IMAP yra tas, kaip el. pašto klientai (pašto skaitymo programos) elgiasi su laiškais serveryje.
Naudojant POP3 (Post Office Protocol), visi laiškai atsisiunčiami iš serverio į nustatytą įrenginį (pvz., kompiuterį ar telefoną). Šiandien dauguma programų leidžia nustatyti, kad POP3 protokolu siunčiant būtų palikta kopija serveryje. Outlook numatytoji nuostata yra saugoti laiškus serveryje 14 dienų.
Naudojant IMAP (Internet Mail Access Protocol), tiek gauti, tiek išsiųsti laiškai vienu metu saugomi serveryje ir el. pašto programoje. Šis protokolas leidžia daryti kasdienes laiškų atsargines kopijas, todėl tai yra saugesnis pasirinkimas tuo atveju, jei jūsų kompiuteris sugenda.
